南模初级中学是上海市教育科学研究院普通教育研究所基地学校。南模初中的教育科研工作正式起步于2002年2月，学校以《提高初中生自我效能的探索与实践》为龙头课题，开展了全校范围的教育科研工作。在两年的研究过程中，学校形成了“科研兴校、科研兴师”的浓厚教科研氛围，教育科研机制得到了完善，教师的教育科研能力显著提高，学生的精神面貌焕然一新。2002年12月和2003年12月举办的两次教科研节更是向全区、全市展示了我校的教育科研工作所取得的成果。

目前，我校的教育科研工作在本区的公办初级中学中有一定的影响力。我校教师撰写的二十多篇文章刊登在国家、市、区级各类刊物上，教育科研所获奖项十多个，正在研究的市级课题共5项，教育科研工作已经成为我校的一个特色和亮点。